Šv. Jono koplytėlė dar vadinama Sukilėlių koplytėle. 1768 m. ją pastatė Dominykas Medekša savo jauniausio sūnaus Teodoro, žuvusio mūšyje prie Višakio Rūdos, atminimui. Vykstant 1831 m. sukilimui Žeimių dvare kurį laiką veikė sukilėlių vadovybės štabas bei buvo formuojama sukilėlių kariuomenė. Turbūt tada koplytėlei ir prigijo Sukilėlių vardas. 

Koplytėlė buvo restauruota 1969 m., 1997 m. Pastarosios restauracijos metu į antrąjį aukštą įkelta medinė šv. Jono skulptūra. 

Po 2014 m. restauracijos Žeimių baroko perlas atgavo senąją stogo formą, sutvarkyta aplinka, apšviesta teritorija. Koplytėlės atvaizdas panaudotas kuriant miestelio herbą ir vėliavą.